* SLC 関係 [#kbfe9a1e]
SLC のインストールの際に CERN のレポジトリで何が導入されるか比較する。&br;
とりあえず
http://linuxsoft.cern.ch/cern/slc5X/x86_64/yum/os/repoview/
http://linuxsoft.cern.ch/cern/slc5X/x86_64/yum/updates/repoview/
http://linuxsoft.cern.ch/cern/slc5X/x86_64/yum/extras/repoview/
あたりを入れておくと問題ない
http://linuxsoft.cern.ch/ 、http://linux.web.cern.ch/linux/updates/slc5.shtml参照
*GWサーバ [#ob8c17cb]
GWサーバには /afs/cern.ch をマウントさせる。
**Kerberosの設定 [#m633793c]
まず、接続先の IP を調べておく。~
afs 接続先サーバ
afskrb5m.cern.ch
afsdb1.cern.ch
afsdb2.cern.ch
afsdb3.cern.ch
11/29にテスト済み~
2012/1/16から afsdb1/2/3 は廃止 cerndb に変更
afskrb5m.cern.ch
cerndb.cern.ch
そのままではkinitにpathが通っていないので以下のdirectryにpathを通しておく
/usr/sue/bin
/usr/kerberos/bin
次にLXPLUSの /etc/krb5.conf をコピーしてくる。~
それが終わったら以下のコマンドを実行
kinit -5 username@CERN.CH
/afs/cern.ch/users/X/XXX/private 以下の自分のフォルダ内が読み書きできることを確かめる。~
ついでに
klist
をやってみて ticket がいつまで有効か確かめてみる。
Ticket cache: FILE:/tmp/krb5cc_500_5F99ut
Default principal: wakajun@CERN.CH
Valid starting Expires Service principal
10/28/10 12:47:29 10/29/10 13:47:29 krbtgt/CERN.CH@CERN.CH
renew until 11/02/10 11:47:29
10/28/10 12:47:33 10/29/10 13:47:29 afs@CERN.CH
renew until 11/02/10 11:47:29
Kerberos 4 ticket cache: /tmp/tkt500
klist: You have no tickets cached
afs@CERN.CH のチケットがあればOK。~
参考URL : http://linux.web.cern.ch/linux/docs/kerberos-access.shtml
*インストールパッケージ [#f0a8ceb4]
ATLAS 関係でインストールしてもらいたいパッケージは以下
SUN java
subversion
cvs
python
ROOT
Ahetena で必要な物~
http://linuxsoft.cern.ch/cern/slc5X/i386/SL~
http://linuxsoft.cern.ch/cern/slc5X/i386/updates/RPMS/
* compat-glibc
* compat-glibc-headers
* compat-libf2c-34
* compat-libgcc-296
* compat-libstdc++-296
* compat-libstdc++-33
* compat-readline43
* lapack-3.0-37.el5
* libgfortran-4.1.2
* ghostscript-8.15.2 (brings ps2pdf needed by perfmon.py)
* libXpm-3.5.5
* glibc-devel-2.5 (if you get gnu/stubs-32.h: No such file or directory during compilation.)
* giflib (for TBrowser etc)
* compat-openldap (dq2-get / lcg-cp will not work without libldap-2.2.so.7) NEEDED on SLC5 32bit as well
* openssl097a-0.9.7a-9.el5_2.1
* openssl-0.9.8e-12.el5_4.1
* compat-db-4.2.52-5.1
* libxml2-devel-2.6.26-2.1.2.8 (needed for GoodRunsLists to compile)
* libaio-0.3.106-3.2 (needed for oracle 11 client, which will come with LCG58a)
ライブラリディスクに置いておく物(これは自分たちで管理を行う)
gcc43
Athetna
DQ2 tool
Grid UI
panda
これらのインストール場所は/afs/cern.ch/ 以下と同じディレクトリ構造にする。
*ATLAS解析用ライブラリの導入 [#o699a2e0]
パッケージの導入の際にはwgetなどを使用するためにproxyの設定を行っておく。
export http_proxy='http://192.168.6.41:3128/'
export https_proxy='http://192.168.6.41:3128/'
export ftp_proxy='http://192.168.6.41:3128/'
ただし、GWサーバでは指定しなくても良い。~
パッケージの導入は"atlas"アカウントになり行う。
パスワードは直接聞いてください。
また、パッケージのパスは以下のようにする。
NGYROOT=/home/nbl/atlas
以下に個別のパッケージのインストール方法、場所を記述する。
**pacman [#cb58f06a]
インストールpath
${NGYROOT}/atlas/software/pacman/
tar で導入
mkdir -p atlas/software/pacman
cd atlas/software/pacman
wget wget http://atlas.bu.edu/~youssef/pacman/sample_cache/tarballs/pacman-latest.tar.gz
tar zxvf pacman-latest.tar.gz
ln -s pacman-x.xx pacman-latest
cd pacman-latest
source setup.sh
cd ../
pacman -lc am-CERN
**athena [#fd864ca6]
インストールpath
${NGYROOT}/atlas/software/releases/1X.X.X
pacman で導入~
まず、上のようにpacmanをセットアップする。
mkdir -p atlas/software/releases/1X.X.X
cd atlas/software/releases/1X.X.X
pacman -allow tar-overwrite -get am-CERN:1X.X.X
ここではCERNのキャッシュを持ってきているが、BNLの方が早い。
また、非公式ではあるがiceppでも独自にキャッシュを持っている。
***AtlasProduction,AtlasPhysisc releaseの導入 [#zd87d4f3]
16.6.5.1のように4桁のreleaseの導入は親になるreleaseの導入後、athenaをセットアップし導入する。
まず、新しいシェルを立ち上げてから設定を始める。
souce setup-16.sh 16.6.5
cd ~/atlas/software/pacman/pacman-latest
souce setup.sh
cd ../
pacman -lc am-CERN
cd ~/atlas/software/releases/16.6.5
pacman -allow tar-overwrite -get am-CERN:AtlasProduction16.6.5.1
**gcc43 [#ya83055e]
インストールpath
${NGYROOT}/sw/lcg/contrib/gcc/
pacmanで導入
mkdir -p /sw/lcg/contrib/gcc/
pacman am-CERN:gcc43-x86_64-slc5-opt
**glight-UI tool [#aa5df3df]
インストールpath
${NGYROOT}/project/gd/LCG-share/X.X.X-X/
tarで導入~
リリースは以下のページを参照~
http://grid-deployment.web.cern.ch/grid-deployment/download/relocatable/glite-UI/SL5_x86_64/
mkdir -p project/gd/LCG-share/3.2.8-0
cd project/gd/LCG-share/3.2.8-0
wget http://grid-deployment.web.cern.ch/grid-deployment/download/relocatable/glite-UI/SL5_x86_64/glite-UI-3.2.8-0.sl5-external.tar.gz
wget http://grid-deployment.web.cern.ch/grid-deployment/download/relocatable/glite-UI/SL5_x86_64/glite-UI-3.2.8-0.sl5.tar.gz
tar zxvf glite-UI-3.2.8-0.sl5.tar.gz
tar zxvf glite-UI-3.2.8-0.sl5-external.tar.gz
mkdir -p external/etc/grid-security/certificates
次に、site-info.defを以下の内容のように作る。
iceppの下にぶら下がるように設定する。
新しいバージョンをインストールする際にはINSTALL_ROOTを変更する事を忘れないようにする。
INSTALL_ROOT=/home/nbl/atlas/project/gd/LCG-share/3.2.8-0
GLITE_EXTERNAL_ROOT=${INSTALL_ROOT}/external
GRID_ENV_LOCATION=${GLITE_EXTERNAL_ROOT}/etc/profile.d
RB_HOST=lcg-rb01.icepp.jp
WMS_HOST=lcg-wms01.icepp.jp
PX_HOST=lcg-px01.icepp.jp
BDII_HOST=lcg-bdii01.icepp.jp
MON_HOST=lcg-mon01.icepp.jp
LB_HOST=lcg-wms01.icepp.jp
REG_HOST=lcgic01.gridpp.rl.ac.uk
CA_REPOSITORY="rpm http://linuxsoft.cern.ch/ LCG-CAs/current production"
FUNCTIONS_DIR=${INSTALL_ROOT}/glite/yaim/functions
GLOBUS_TCP_PORT_RANGE="20000,25000"
JAVA_LOCATION=/usr/java/jdk1.5.0_22
VOS="atlas"
VO_ATLAS_VOMS_SERVERS='vomss://voms.cern.ch:8443/voms/atlas?/atlas/'
VO_ATLAS_VOMSES="'atlas lcg-voms.cern.ch 15001 \
/DC=ch/DC=cern/OU=computers/CN=lcg-voms.cern.ch atlas 24' \
'atlas voms.cern.ch 15001 \
/DC=ch/DC=cern/OU=computers/CN=voms.cern.ch atlas 24'"
VO_ATLAS_VOMS_CA_DN="'/DC=ch/DC=cern/CN=CERN Trusted Certification Authority' '/DC=ch/DC=cern/CN=CERN Trusted Certification Authority'"
X509_CERT_DIR=${INSTALL_ROOT}/external/etc/grid-security/certificates
SITE_NAME=NAGOYA
最後にyaim installをして完了
./glite/yaim/bin/yaim -c -s site-info.def -n UI_TAR
/etc/hosts にhostnameとドメインが書いてないとこれに失敗する。
**DQ2 tool [#r66694fb]
インストールpath
&{NGYROOT}/atlas/offline/external/GRID/ddm/DQ2Clients/x.x.x
pacmanで導入
pacman -trust-all-caches -allow tar-overwrite -get http://atlas.web.cern.ch/Atlas/GROUPS/DATABASE/project/ddm/releases/pacman/cache:DQ2Clients
//python2.5またはpython2.6を使うバージョンではpythonとライブラリが必要になる。
//python2.6の導入はpacmanで行える。ディレクトリ構造もAFSと同じ場所に配置される。
//ライブラリは以下の場所から持ってきて解凍、配置する。
// https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/Atlas/RPMCompatSLC5#In_addition
**panda-client [#ufe2a047]
インストールpath
${NGYROOT}/atlas/offline/external/GRID/DA/panda-client/x.x.x
tarで導入~
参考url:https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/Atlas/PandaTools
mkdir -p atlas/offline/external/GRID/DA/panda-client
wget https://twiki.cern.ch/twiki/pub/Atlas/PandaTools/panda-client-0.2.8.tar.gz
tar xvfz panda-client-0.2.8
mv panda-client-0.2.8 0.2.8
python setup.py install --prefix=/home/nbl/atlas/atlas/offline/external/GRID/DA/panda-client/0.2.8
グリッドジョブを投げるときにカレントバージョンより新しいバージョンがあれば警告が出る。
*メンテナンス情報 [#g29e5fcd]
以下のページを読んでメンテナンスを行う。
-Athea~
https://twiki.cern.ch/twiki/bin/viewauth/Atlas/WorkBookInstallingAtlasSoftware~
http://atlas-computing.web.cern.ch/atlas-computing/projects/releases/status/
-gLite~
http://glite.cern.ch/R3.2/~
http://glite.cern.ch/glite-UI/
-Panda~
https://twiki.cern.ch/twiki/bin/viewauth/Atlas/PandaTools
-DQ2tool~
https://twiki.cern.ch/twiki/bin/viewauth/Atlas/DQ2Clients~
https://twiki.cern.ch/twiki/bin/viewauth/Atlas/DDMClientInstallation
-ROOT~
http://root.cern.ch/drupal/
**python2.6 [#ed09a2d2]
pacmanを使ってインストールできる。
${NGYROOT}でコマンドを実行すれば ${NGYROOT}/sw/lcg/external/Python 以下にインストールされる。
pacman -trust-all-caches -allow tar-overwrite -get am-CERN:Python_2_6_5_x86_64_slc5_gcc43_opt
また、ライブラリは別途rpmもしくはtarを持ってきてインストールする。
必要なものは
LFC :
dm-util :
gfal :
https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/Atlas/RPMCompatSLC5
LFC : python26-lfc-1.8.0-1sec.slc5.x86_64.rpm
dm-util : lcg_util_py26-1.11.16-2.tar.gz
gfal : GFAL-client-py26-1.11.16-2.tar.gz
これを${NGYROOT}/sw/lcg/external/Grid/以下にインストールする。
参考URL:https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/Atlas/RPMCompatSLC5
*ROOTを使う [#r75ce1c4]
ROOTの展開場所は以下。
/home/nbl/rootpkgs/
ここから自分が使いたいバージョンを指定してパスを通す。
ただし、gcc4.3 系を使う場合には gcc4.3 にパスを通すことを忘れないように。
gcc4.3 のパスは以下
/home/nbl/atlas/sw/lcg/contrib/gcc
ここの setup.sh もしくは setup.csh を source しておく
[[計算機関係]]